Zakaj se GAPDH uporablja v Western Blot? + Primer

Zakaj se GAPDH uporablja v Western Blot? + Primer
Anonim

Odgovor:

GAPDH se pogosto uporablja kot obremenitveni nadzor.

Pojasnilo:

V Western blotingu pogosto uporabljamo GAPDH kot kontrolo nakladanja. To pomeni, da lahko s sondiranjem za GAPDH preverimo, da imamo na različnih pasovih madežev naložene enakovredne količine beljakovin.

Primer uporabe - recimo, da imamo bolezen, za katero menimo, da povzroča zvišanje določene beljakovine v celici. Izdelali bi vzorec iz "zdravih" celic in drugega vzorca iz "bolnih" celic. Nato bi naložili ekvivalentne količine beljakovin obeh vzorcev na gel za Western blot.

Po sondiranju blot-a za naš zanimiv protein smo ugotovili, da je v bolnih celicah raven beljakovin res povišana (to je temnejši pas na blotu). Da bi dokazali, da je to povečanje beljakovine posledica spremembe izražanja v celici, namesto nakladalnega artefakta (to pomeni, da je hitrejši trak povzročena s spremembo ekspresije beljakovin v celicah, in ne z naključno nalaganjem več. vzorca "bolezni", kot je "zdravo"), bi tudi raziskali blot za GAPDH, da pokažemo, da so skupne beljakovine enake v obeh pasovih.

Zato s tem dokazujemo, da je bila v obeh pasovih naložena ekvivalentna beljakovina in da je sprememba v intenzivnosti pasu, ki jo opazujemo, posledica sprememb v izražanju beljakovin, ki nas zanimajo.