Zakaj večina restrikcijskih encimov reže pri palindromskem zaporedju?

Zakaj večina restrikcijskih encimov reže pri palindromskem zaporedju?
Anonim

Odgovor:

Ker je bolj učinkovit.

Pojasnilo:

Encimi, kot so omejevalni encimi, morajo za opravljanje svoje naloge prepoznati zelo specifično zaporedje. Veže se na DNA le v eni specifični konfiguraciji. Na srečo! ker ne želite "pacmana", ki reže DNA na naključnih mestih.

DNK je dvojna, zato ima "dve strani", na katere se encim lahko veže. Palindromsko zaporedje je na obeh straneh enako nazaj in naprej (glej sliko spodaj). To pomeni, da encim prepozna zaporedje, ne glede na to, s katere strani se encim približa DNK.

Palindromska sekvenca prav tako poveča možnost, da se obe vrsti DNA razrežejo. Možno je tudi, da dva encima delujeta kot dimer za rezanje palindromskega zaporedja, kar še povečuje učinkovitost.

Zadnji razlog je bil pomemben v boju med virusi in bakterijami. Bakterije so se razvile v "onemogočanje" virusov, ki so usmerjeni v bakterije (bakteriofagi) z uporabo omejevalnih encimov, ki se vežejo na ta palindromska zaporedja. Rezanje obeh delov DNK škoduje virusu bolj kot rezanje ene niti.